分子膜堆肥發酵采用了無菌系統，避免和防止了空氣中微生物的污染，大大延長了產品的保質期和產品的純，罐體上特別設計安裝了無菌呼吸氣孔或無菌正壓發酵系統。罐體上設有米洛板或迷宮式夾套，可通入加熱介質來進行循環加熱。發酵罐的容量由300-15000L多種不同規格。

分子膜堆肥發酵用于厭氣發酵（如生產酒精、溶劑）的發酵罐結構可以較簡單。用于好氣發酵（如生產抗生素、氨基酸、有機酸、維生素等）的發酵罐因需向罐中連續通入大量無菌空氣，并為考慮通入空氣的利用率，故在發酵罐結構上較為復雜，常用的有機械攪拌式發酵罐、鼓泡式發酵罐和氣升式發酵罐。

分子膜堆肥發酵的分類：按照發酵罐的設備，分為機械攪拌通風發酵罐和非機械攪拌通風發酵罐；

按照微生物的生長代謝需要，分為好氣型發酵罐和厭氣型發酵灌。

分子膜堆肥發酵是一種對物料進行機械攪拌與發酵的設備。該設備采用內循環方式，用攪拌槳分散和打碎氣泡，它溶氧速率高，混合效果好。罐體采用SUS304或316L進口不銹鋼，罐內配有自動噴淋清洗機頭，確保生產過程符合GMP要求。